程千帆教授对文史的研究是契而不舍的，对自己的学生也是循循善诱的，然而他对不平的世事却是从不客气的。还是在1944年，金陵大学发生学校教会负责人贪污教师平价米事件。程千帆夫妇告发此事反受不公正处理，一气之下，写了四首《鹧鹄天》以记录这件事。其中第一首云：

　　百尺高楼数仞墙， 蛮弦羯鼓度新腔。

　　暗收香稻防鹦鹉， 故听孤桐恼凤凰。

　　春漏泄，意怆皇。 记名瑶册忍相忘。

　　何曾一斗供闲醉， 空自殷勤捧玉觞。

　　词中对当局见利忘义、中饱私囊和欺骗教师、扼杀正义的行径可谓义愤填膺，深恶痛绝!

　　就是因为这种刚直不阿的性格，程千帆教授在1957反右派政治运动中，受到了不公正的处理。首先是撤销了教授职称和中文系主任职务，离开了工作二十多年的讲台和和谐相处的学生，到学校资料室抄了几年的卡片。后来到学校建筑工地参加劳动。再后来到八里湖、沙洋等地参加体力劳动，一连多年不能回家。夫人沈祖芬在思念中写诗云：

　　历尽新婚成老别，

　　未成白首碧山期。

　　在如此艰辛的逆境中，程千帆始终执著地热爱自己的文史研究。在穿着袜子下污泥沟做事的时候，他一面铲污泥，一面思索着《宋诗选》一书的修改；在没有水洗澡的沙洋农场里，他思索着自己还能读书、还能想问题，所做地工作是对人民有用的，将来总有一天还会用得着；在摘了帽子留在五七干校的时候，他抓紧时间，校王安石的诗，批注《杜诗镜诠》；在文稿失而复得时，他一个字一个字地抄写，一本厚厚的《史通笺记》，硬是工工整整地抄了两遍……

　　这种精神的压抑和体力的透支，竟然持续了一十八年!程千帆由年富有力强的不惑之年，变成了白发苍苍的花甲老者。这是何等漫长的岁月呀!这是何等漫长的等待呀!

　　此情可待成追忆，

　　只是当时已惘然。

　　就是怀着有些惘然和不懈追求交织在一起的心境，程千帆教授终于回到了武汉大学。

　　正当他的精神有所轻松的时候，夫人沈祖芬突遇车祸离世。程千帆的心又痛得流血了。沈祖芬教授为了爱情，跟着程千帆受了很多苦；程千帆教授为了爱情，在沈祖芬身后默默地整理她的学术著作和小说。后来，沈教授的著作出版了，小说则收进了冰心、柯灵主编的小说集中，程千帆教授以此视为永远的纪念。

　　此后有一段不太长的时间，程千帆教授住在一栋修建长江大桥时的司机房里，重新拿起了著书立说的笔。